vagabond

vagabond è uno strumento software cristallografico open source per la raffinazione delle strutture proteiche. È progettato per gli utenti che hanno bisogno di lavorare con modelli di struttura proteica in un ambiente educativo o scientifico. Il suo scopo primario è quello di sostenere la fase di raffinazione del lavoro della struttura proteica.

Il software si concentra sul miglioramento e l'esame dei modelli di struttura proteica attraverso la raffinatezza cristallica. Ciò rende rilevante agli studenti e ai professionisti che studiano come vengono elaborati i dati della struttura sperimentale. vagabond è distinta da cluster4x, che viene utilizzato per raggruppare i set di dati piuttosto che per raffinare le strutture proteiche.

Come applicazione Linux, vagabond si adatta agli ambienti in cui vengono utilizzati strumenti cristallografici su quel sistema operativo. La sua licenza open source consente al software di essere utilizzato come software disponibile all'interno dei termini di tale licenza. Il posizionamento nella categoria di istruzione di MirrorNest riflette il suo legame con l'analisi della struttura proteica e l'apprendimento.

MirrorNest specchia la vagabond ufficiale costruire direttamente sul proprio storage. Prima di pubblicare la costruzione a specchio, MirrorNest lo scansiona per il malware. Questo dà agli utenti Linux un modo basato sul catalogo per ottenere la costruzione ufficiale, mantenendo la piattaforma del software e le informazioni di licenza visibili.