vagabond0.3.01ffda07

vagabond を使用して構造実験から得られた電子密度データに対してタンパク質構造モデルを精密化し、それらのモデルを適合・改善する結晶学的段階をサポートします。結合ベースの精密化アルゴリズムは、化学結合によって表される原子間の関係を維持しながらモデルを調整します。目標は、タンパク質結晶の実際の内容を可能な限り忠実に表現することです。

実験的な構造データが三次元の解釈になるかを調べて、タンパク質モデルを調べ、精製することができます。 プログラムは、結晶状方法、実験室の研究、およびタンパク質構造を含む科学的作業を教えるのに適しています。 データセットのグループ化ではなく、リファインメントに集中し、クラスター4xとは別に設定します。 その区別は、関連する実験データをグループにソートするのではなく、タスクがタンパク質モデルを改善するときに、ユーザーがvagabondを選ぶのに役立ちます。

Helen Ginnは、オープンソースライセンスの下でLinux用のvagabondを公開し、現在のバージョンはv0.3.01ffda07です。 Linux をスナップし、x86 64 ハードウェア上で実行する必要があります。また amd64 として識別されます。 その結果、将来のユーザーは、使用する前に、これらのシステムとアーキテクチャの要件に一致するLinuxの結晶環境を持っている必要があります。